Il convento dei cappuccini di Malles Venosta fu fondato nel 1697. Nel 1799, un incendio devastò la chiesa e il convento, che furono ben presto ricostruiti. Il convento fu poi soppresso nel 1808 durante il governo bavarese, ma già l'anno seguente i padri cappuccini poterono farvi ritorno. A causa della carenza di vocazioni, nel 1991 il convento fu abbandonato e venduto alla Provincia autonoma di Bolzano. Oggi, l'ex convento ospita una casa di riposo.

All'inizio degli anni '90, la biblioteca dei cappuccini di Malles fu trasferita nel convento dei francescani di Bolzano e ricollocata unitariamente in uno dei magazzini di libri sotterranei.

La collezione comprende complessivamente circa 6.000 volumi. Non sono presenti incunaboli e i libri più antichi risalgono al 1506. Le stampe del XVI secolo formano l'1,1% del patrimonio complessivo, quelle del XVII secolo invece circa il 4%. La maggior parte delle opere risale al XVIII e XIX secolo. A livello tematico prevalgono, secondo Germiniasi, opere afferenti alla teologia (in particolare studi biblici, teologia morale e pastorale) e alla filosofia. La biblioteca dei cappuccini di Malles è stata catalogata all'inizio degli anni 2000 nell'ambito del progetto del CBS.